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功能性靶點篩選如何實現(xiàn)“彎道超車”,基于RNAi的高內(nèi)涵篩選技術(shù)了解一下!

功能性靶點篩選如何實現(xiàn)“彎道超車”,基于RNAi的高內(nèi)涵篩選技術(shù)了解一下!

高內(nèi)涵篩選(High-content screening,HCS),又稱高內(nèi)涵分析(high-content analysis,HCA)是指在保持細胞結(jié)構(gòu)和功能完整性的前提下,同時檢測被篩樣品對細胞形態(tài)、生長、分化、遷移、凋亡、代謝途徑及信號轉(zhuǎn)導各個環(huán)節(jié)的影響, 在單一實驗中獲取大量與基因及其他細胞成分相關的信息, 確定其生物活性和潛在毒性的過程。同時, 也是一種應用高分辨率的熒光數(shù)碼影像系統(tǒng),旨在獲得被篩樣品對細胞產(chǎn)生的多維立體和實時快速的生物效應信息, 在細胞水平上檢測多個指標的多元化、功能性篩選技術(shù)平臺。...

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Theranostics丨RNA測序+siRNA文庫細胞功能篩選快速鑒定乳腺癌化療耐藥基因及其機理

Theranostics丨RNA測序+siRNA文庫細胞功能篩選快速鑒定乳腺癌化療耐藥基因及其機理

紫杉烷類是三陰性乳腺癌(TNBC)患者的一線化療藥物;但是,化學抗性會降低其有效性。研究人員假設新輔助化療(NAC)前后腫瘤標本的分子圖譜將有助于鑒定與耐藥相關的基因。 因此,研究人員通過RNA-seq對來自于8例新輔助化療TNBC患者的10個樣品進行了測序,其中3例病理完全緩解(pCR),5例為非pCR。選擇能夠預測化療應答的差異表達基因,并通過小規(guī)模siRNA文庫進行體外功能篩選。然后,進一步在體內(nèi)外研究TNBC相關基因的臨床和功能意義,并應用生化實驗和成像分析來研究其作用機制。...

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高通量基因功能篩選研究利器–siRNA Library

高通量基因功能篩選研究利器–siRNA Library

siRNA基因文庫帶來了功能基因組學研究的效率革命,為功能機制研究、全新靶點發(fā)現(xiàn)、藥物研發(fā)等提供了一種更高效的途徑,誕生了眾多原創(chuàng)性突破性的研究成果,高內(nèi)涵分析與篩選平臺更是讓siRNA基因文庫的應用最大化。 銳博生物采用siCatchTM siRNA優(yōu)化設計算法,成功構(gòu)建了genOFF Human Genome siRNA Premix Library、genOFF Human RBP siRNA Premix...

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如何發(fā)現(xiàn)lncRNA中m6A新功能,不妨了解下這篇15分paper的研究思路

如何發(fā)現(xiàn)lncRNA中m6A新功能,不妨了解下這篇15分paper的研究思路

N6-甲基腺苷(m6A)是哺乳動物細胞中最普遍的mRNA修飾。然而,m6A在特定致癌長鏈非編碼RNAs(ncRNAs)上的疾病相關功能尚不清楚。為此,天津醫(yī)科大學第二醫(yī)院牛遠杰課題組在Molecular Cancer期刊上發(fā)表了題為Long non-coding RNA NEAT1 promotes bone metastasis of prostate cancer through N6-methyladenosine的研究論文。揭示了ncRNA NEAT1-1上的m6A在調(diào)節(jié)Pol II...

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MeRIP-Seq助力揭示IGF2BP2促進肝癌生長的m6A-FEN1依賴性機制

MeRIP-Seq助力揭示IGF2BP2促進肝癌生長的m6A-FEN1依賴性機制

肝細胞癌(HCC)是中國最常見的惡性腫瘤之一。N6-甲基腺苷(m6A)在轉(zhuǎn)錄后基因調(diào)控中起重要作用。METTL3和IGF2BP2是m6A信號通路中的關鍵基因,最近被證明在癌癥發(fā)展和進展中發(fā)揮重要作用。然而,在HCC中,m6A修飾的功能以及m6A甲基轉(zhuǎn)移酶、去甲基化酶和m6A結(jié)合蛋白之間的潛在聯(lián)系仍然不清楚。 ? 為了解決這個問題,廣西右江民族醫(yī)學院附屬醫(yī)院韋花媚課題組發(fā)表了題為IGF2BP2 Promotes Liver Cancer Growth Through an m6A-FEN1-Dependent...

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Redox Biol (IF9.986)丨m6A閱讀器蛋白YTHDC2通過抑制SLC7A11依賴性抗氧化功能來抑制肺腺癌的發(fā)生

Redox Biol (IF9.986)丨m6A閱讀器蛋白YTHDC2通過抑制SLC7A11依賴性抗氧化功能來抑制肺腺癌的發(fā)生

N6-甲基腺苷(m6A)RNA甲基化的生物學功能主要依賴于閱讀器蛋白;然而,其在肺腫瘤發(fā)生中的作用仍不清楚。近日,上海市胸科醫(yī)院王佳誼課題組在Redox Biology期刊發(fā)表了題為The m6A reader YTHDC2 inhibits lung adenocarcinoma tumorigenesis by suppressing SLC7A11-dependent antioxidant function的研究論文。重點突出了: ? m6A閱讀器蛋白YTHDC2在LUAD中經(jīng)常被抑制,預示著預后不良; ?...

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收藏丨推薦兩個非常值得借鑒的m6A研究方案!

收藏丨推薦兩個非常值得借鑒的m6A研究方案!

重要的事情提前說!!! ? 一、銳博生物重磅推出的m6A甲基化RNA免疫沉淀試劑盒已經(jīng)上市啦!即日起-4月30日,凡是在銳博生物在線平臺下單即可享受活動價7074元+500元無門檻代金券! 二、即日起-4月30日,凡是在銳博生物在線平臺委托MeRIP-Seq/m6A-Seq服務即可免費贈送4-6項高級生信分析!活動詳情請登錄銳博官網(wǎng)(m.jyzfjx.com)進行查看! ? 接下來,小編就給大家推薦兩個非常值得借鑒的m6A研究方案! ? ? 研究方案Ⅰ...

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m6A新研究進展盤點(20210316)

m6A新研究進展盤點(20210316)

Nat Commun丨神經(jīng)m6A/Ythdf通路是果蠅學習和記憶所必需的 IF:12.121 2021-3-5表觀轉(zhuǎn)錄組修飾可以影響行為。本研究使用果蠅(Drosophila melanogaster)研究mRNA最豐富的修飾N6-甲基腺苷(m6A)。蛋白質(zhì)組學和功能分析證實其細胞核(Ythdc1)和細胞質(zhì)(Ythdf)YTH結(jié)構(gòu)域蛋白是主要的m6A結(jié)合物。在m6A突變體中進行的短期記憶檢測揭示了通過Ythdf,而不是Ythdc1起作用的m6A...

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Science子刊丨漿細胞通過轉(zhuǎn)移外泌體miRNAs來塑造卵巢癌的間充質(zhì)特性

Science子刊丨漿細胞通過轉(zhuǎn)移外泌體miRNAs來塑造卵巢癌的間充質(zhì)特性

卵巢癌是女性最致命的惡性腫瘤之一,在腫瘤生物學和臨床預后中表現(xiàn)出很大的異質(zhì)性。癌細胞的基因組變化將患者分為不同的亞組,它們具有不同的預后和對治療的反應。由于癌組織是由癌細胞和非腫瘤細胞組成,對這些非腫瘤細胞的功能研究較少。腫瘤免疫學的成功促使了人們對浸潤性免疫細胞的研究,以預測臨床預后和對治療的反應。  ...

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