Distinct Stress-Dependent Signatures of Cellular and Extracellular tRNA-Derived Small RNAs
細(xì)胞和細(xì)胞外tRNA衍生的小RNAs的不同應(yīng)激依賴(lài)性特征
發(fā)表期刊：Adv Sci (Weinh)
影響因子：16.806
發(fā)表時(shí)間：2022年4月4日
細(xì)胞對(duì)應(yīng)激的反應(yīng)是疾病發(fā)病機(jī)制的重要決定因素。揭示不同應(yīng)激反應(yīng)的分子指紋可以識(shí)別不同疾病的新型生物標(biāo)志物和關(guān)鍵信號(hào)通路。新出現(xiàn)的證據(jù)表明，轉(zhuǎn)移RNA衍生的小RNAs（tDRs）在應(yīng)激反應(yīng)中發(fā)揮關(guān)鍵作用。然而，tDRs上存在的RNA修飾是使用傳統(tǒng)小RNA測(cè)序準(zhǔn)確定量tDRs的障礙。本研究使用ARM-seq（AlkB-facilitated methylation sequencing），在各種細(xì)胞類(lèi)型不同的應(yīng)激反應(yīng)期間生成了細(xì)胞和細(xì)胞外tDR豐度的全面景觀。發(fā)現(xiàn)細(xì)胞外tDRs具有與細(xì)胞內(nèi)tDRs不同的片段化特征，這些tDR特征比miRNAs更能指示不同的應(yīng)激反應(yīng)。在心肺轉(zhuǎn)流患者的血漿中也觀察到這些不同的細(xì)胞外tDR片段化模式和特征。此外，研究還證明血管生成素和RNASE1本身也受到應(yīng)激源的調(diào)節(jié)，并有助于細(xì)胞和細(xì)胞外tDRs亞群的應(yīng)激調(diào)節(jié)豐度。最后，研究人員確定了一個(gè)細(xì)胞外tDRs亞群，其表達(dá)似乎需要AGO2。總之，這些發(fā)現(xiàn)提供了應(yīng)激反應(yīng)性tDRs的詳細(xì)概況，并提供了關(guān)于tDR生物發(fā)生和對(duì)細(xì)胞應(yīng)激源反應(yīng)的穩(wěn)定性的見(jiàn)解。
Fig1. ARM-seq揭示應(yīng)激反應(yīng)期間細(xì)胞和細(xì)胞外tDR表達(dá)譜的可靠信息
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35373532/
MicroRNAs signatures associated with vulnerability to food addiction in mice and humans
與小鼠和人類(lèi)食物成癮脆弱性相關(guān)的MicroRNAs特征
發(fā)表期刊：J Clin Invest
影響因子：14.808
發(fā)表時(shí)間：2022年3月29日
食物成癮的特征是失去對(duì)食物攝入的行為控制，并與肥胖和其他飲食失調(diào)有關(guān)。這種行為障礙背后的機(jī)制在很大程度上是未知的。本研究旨在探索動(dòng)物和人類(lèi)食物成癮所促進(jìn)的miRNAs表達(dá)的變化，以及它們參與這種障礙行為特征的潛在機(jī)制。研究顯示，在動(dòng)物隊(duì)列中，內(nèi)側(cè)前額葉皮層（mPFC）中的miRNAs特征與人類(lèi)隊(duì)列中的miRNAs循環(huán)水平之間發(fā)現(xiàn)了明顯的相似性，從而可以確定幾種可能對(duì)這種疾病的發(fā)展有潛在興趣的miRNAs。小鼠mPFC中miRNA-29c-3p的TuD抑制促進(jìn)了對(duì)反應(yīng)的持久性，并增強(qiáng)了發(fā)展食物成癮的脆弱性，而miRNA-665-3p抑制促進(jìn)了強(qiáng)迫樣行為并增強(qiáng)了食物成癮的脆弱性。相反，mPFC中的miRNA-137-3p抑制并不影響食物成癮的發(fā)展。因此，miRNA-29c-3p和miRNA-665-3p可以作為食物成癮的保護(hù)因子。基于現(xiàn)在可用于修改miRNA活性和表達(dá)的策略，對(duì)這些新的表觀遺傳機(jī)制的闡明為創(chuàng)新的生物標(biāo)志物和可能的未來(lái)對(duì)食物成癮和相關(guān)疾病的干預(yù)提供了見(jiàn)解。
Fig2. 在人類(lèi)隊(duì)列中比較非成癮者（“NA”）和成癮者（“A”）個(gè)體成癮的三個(gè)標(biāo)志的行為結(jié)果
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35349487/
miR-374a-5p regulates inflammatory genes and monocyte function in patients with inflammatory bowel disease
miR-374a-5p調(diào)節(jié)炎癥性腸病患者的炎癥基因和單核細(xì)胞功能
發(fā)表期刊：J Exp Med
影響因子：14.307
發(fā)表時(shí)間：2022年4月1日
MicroRNAs是控制細(xì)胞過(guò)程（包括炎癥）的基因表達(dá)的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子。本研究探索了它們?cè)谘装Y性腸病（IBD）發(fā)病機(jī)制中的作用，并確定了miR-374a-5p在IBD單核細(xì)胞中的表達(dá)降低，這與炎癥反應(yīng)相關(guān)的上調(diào)基因模塊相關(guān)。關(guān)鍵的促炎模塊基因（包括TNFα、IL1A、IL6 和OSM）與miR-374a-5p呈負(fù)相關(guān)，并在體外得到了驗(yàn)證。在結(jié)腸活檢中，miR-374a-5p的表達(dá)再次降低，并與相同的炎癥模塊呈負(fù)相關(guān)，其水平預(yù)測(cè)了隨后對(duì)anti-TNF治療的反應(yīng)。增加miR-374a-5p的表達(dá)被證明通過(guò)抑制促炎介質(zhì)來(lái)控制巨噬細(xì)胞驅(qū)動(dòng)的炎癥，并降低單核細(xì)胞遷移和激活T細(xì)胞的能力。本研究結(jié)果表明，miR-374a-5p減少是IBD炎癥的主要驅(qū)動(dòng)因素，其治療性補(bǔ)充劑可以減少I(mǎi)BD或其他免疫介導(dǎo)疾病中單核細(xì)胞驅(qū)動(dòng)的炎癥。
Fig3. miR-374a-5p調(diào)節(jié)關(guān)鍵單核細(xì)胞功能（如遷移和T細(xì)胞活化）
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35363256/
Stem cell-homing hydrogel-based miR-29b-5p delivery promotes cartilage regeneration by suppressing senescence in an osteoarthritis rat model
基于干細(xì)胞歸巢水凝膠的miR-29b-5p遞送通過(guò)抑制骨關(guān)節(jié)炎大鼠模型中的衰老來(lái)促進(jìn)軟骨再生
發(fā)表期刊：Science Advances
影響因子：14.136
發(fā)表時(shí)間：2022年3月30日
骨關(guān)節(jié)炎（Osteoarthritis，OA）是一種常見(jiàn)的關(guān)節(jié)疾病，其特征是軟骨進(jìn)行性喪失和潤(rùn)滑滑液減少，目前缺乏有效的治療方法。本研究提出了一種基于水凝膠的miRNA遞送策略，通過(guò)創(chuàng)建一個(gè)再生微環(huán)境來(lái)減輕軟骨細(xì)胞衰老（軟骨細(xì)胞衰老主要導(dǎo)致OA發(fā)展過(guò)程中的軟骨破裂），從而使受損的軟骨恢復(fù)活力。研究人員首次發(fā)現(xiàn)一個(gè)衰老相關(guān)的miRNA miR-29b-5p在OA軟骨中顯著下調(diào)，其上調(diào)通過(guò) TET1（10-11轉(zhuǎn)位酶1）抑制P16INK4a/P21（基質(zhì)金屬蛋白酶和衰老相關(guān)基因）的表達(dá)。一種可注射的生物活性自組裝肽納米纖維水凝膠被用于遞送 agomir-29b-5p，該水凝膠是通過(guò)偶聯(lián)干細(xì)胞歸巢肽SKPPGTSS進(jìn)行功能化的，同時(shí)用于內(nèi)源性滑膜干細(xì)胞募集。持續(xù)的miR-29b-5p遞送和滑膜干細(xì)胞的募集以及它們隨后分化成軟骨細(xì)胞導(dǎo)致成功的軟骨修復(fù)和軟骨細(xì)胞再生。該策略使基于miRNA的治療方式成為OA手術(shù)治療的一種可行替代方案。
Fig4. SKP@miR減輕大鼠軟骨細(xì)胞的衰老并維持分解代謝平衡
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35353555/
Histone methylation-mediated microRNA-32-5p down-regulation in sensory neurons regulates pain behaviors via targeting Cav3.2 channels
組蛋白甲基化介導(dǎo)的感覺(jué)神經(jīng)元中microRNA-32-5p的下調(diào)通過(guò)靶向Cav3.2通道調(diào)節(jié)疼痛行為
發(fā)表期刊：PNAS
影響因子：11.205
發(fā)表時(shí)間：2022年3月30日
microRNA（miRNA）介導(dǎo)的基因調(diào)控已作為一種治療方法進(jìn)行了研究，但其在神經(jīng)性疼痛中的功能調(diào)控機(jī)制尚不清楚。本研究發(fā)現(xiàn)miRNA-32-5p（miR-32-5p）是一種調(diào)節(jié)三叉神經(jīng)介導(dǎo)的神經(jīng)性疼痛的功能性RNA。高通量測(cè)序和qPCR分析顯示，miR-32-5p是大鼠受損三叉神經(jīng)節(jié)（TG）中下調(diào)最大的miRNA。TG內(nèi)注射miR-32-5p agomir或通過(guò)慢病毒遞送在受損TG的神經(jīng)元中過(guò)表達(dá)miR-32-5p可減輕已建立的三叉神經(jīng)性疼痛。miR-32-5p過(guò)表達(dá)不影響急性生理性疼痛，而完整大鼠中miR-32-5p下調(diào)足以引起疼痛相關(guān)行為。神經(jīng)損傷增加了miR-32-5p啟動(dòng)子區(qū)域中轉(zhuǎn)錄因子糖皮質(zhì)激素受體結(jié)合位點(diǎn)的甲基化組蛋白占有率。抑制催化H3K9me2和H3K27me3的酶可恢復(fù)miR-32-5p的表達(dá)并顯著減輕疼痛行為。此外，miR-32-5p靶向Cav3.2 T型Ca2+通道，減少與神經(jīng)性疼痛相關(guān)的miR-32-5p，導(dǎo)致Cav3.2蛋白表達(dá)和T型通道電流的增加。相反，在受損TG中過(guò)表達(dá)miR-32-5p可抑制Cav3.2表達(dá)增加并逆轉(zhuǎn)機(jī)械異常性疼痛。總之，本研究結(jié)果表明，TG神經(jīng)元中組蛋白甲基化介導(dǎo)的miR-32-5p下調(diào)通過(guò)靶向Cav3.2通道調(diào)節(jié)三叉神經(jīng)性疼痛。
Fig5. miR-32-5p參與神經(jīng)性疼痛的機(jī)制
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35353623/
