Long noncoding RNA TLNC1 promotes the growth and metastasis of liver cancer via inhibition of p53 signaling

長鏈非編碼RNA TLNC1通過抑制p53信號(hào)促進(jìn)肝癌的生長和轉(zhuǎn)移

發(fā)表期刊：Mol Cancer

影響因子：27.401

發(fā)表時(shí)間：2022年4月27日

背景：長鏈非編碼RNAs（lncRNAs）已被證明在癌癥發(fā)展和進(jìn)展中發(fā)揮重要作用。然而，它們?cè)诟伟┲械纳飳W(xué)作用和功能機(jī)制在很大程度上仍然未知。

結(jié)果：基于RNA-seq、TCGA RNA-seq和TCGA生存分析數(shù)據(jù)的交集，本研究將TLNC1鑒定為肝癌的潛在致瘤lncRNA。TLNC1在體內(nèi)外均顯著促進(jìn)肝癌細(xì)胞的生長和轉(zhuǎn)移。TLNC1發(fā)揮其致瘤作用是通過與TPR相互作用并誘導(dǎo)TPR介導(dǎo)的p53從細(xì)胞核到細(xì)胞質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn)，從而抑制p53靶基因的轉(zhuǎn)錄，最終促進(jìn)肝癌的進(jìn)展。

結(jié)論：TLNC1是一種很有前景的肝癌預(yù)后因子，TLNC1-TPR-p53軸可作為肝癌治療的潛在治療靶點(diǎn)。

Fig1. TLNC1在調(diào)節(jié)p53信號(hào)通路中的功能示意圖

原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35477447/

Urinary extracellular vesicles contain mature transcriptome enriched in circular and long noncoding RNAs with functional significance in prostate cancer

尿細(xì)胞外囊泡包含成熟的轉(zhuǎn)錄組，富含在前列腺癌中具有重要功能意義的環(huán)狀和長鏈非編碼RNAs

發(fā)表期刊：J Extracell Vesicles

影響因子：25.841

發(fā)表時(shí)間：2022年5月8日

長鏈非編碼（lnc）RNAs調(diào)節(jié)基因表達(dá)，同時(shí)呈現(xiàn)出意想不到的新抗原來源。盡管他們有巨大的利益，但他們轉(zhuǎn)移和控制相鄰細(xì)胞的能力尚不清楚。細(xì)胞外囊泡（EVs）為核酸提供保護(hù)環(huán)境，通過控制免疫反應(yīng)具有促腫瘤和抗腫瘤功能。與細(xì)胞外非囊泡RNA相比，很少有研究涉及人類體液EVs中的全部RNA內(nèi)含物，并將其與它們的起源組織進(jìn)行比較。本研究對(duì)6個(gè)福爾馬林固定石蠟包埋（FFPE）前列腺癌（PCa）腫瘤組織及其配對(duì)的尿液（u）EVs進(jìn)行了總RNA測序，以提供來自同一患者的第一個(gè)全轉(zhuǎn)錄組比較。UEVs包含有無內(nèi)含子的細(xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)錄本和豐富的lnc/環(huán)狀（circ）RNAs的簡化轉(zhuǎn)錄組，這在獨(dú)立的20例患者的泌尿隊(duì)列中非常常見。研究人員對(duì)三個(gè)PCa細(xì)胞系中的完整細(xì)胞和EVs轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了比較，鑒定了一組重疊的14個(gè)uEV-circRNAs，這些uEV-circRNAs被表征為體外前列腺細(xì)胞增殖所必需的，以及屬于CLC2（Cancer-related LncRNA Census）的28個(gè)uEV-lncRNAs。此外，本研究發(fā)現(xiàn)了15個(gè)uEV-lncRNAs，預(yù)測編碼768種高親和力新抗原，通過質(zhì)譜分析發(fā)現(xiàn)其中3個(gè)編碼的ORF產(chǎn)生了可檢測到的未修飾多肽。本研究對(duì)尿液和體外EVs中EVs-lnc/circRNAs的雙重分析為未來涉及PCa的uEV-lnc/circRNAs表型表征提供了基礎(chǔ)資源。

Fig2. uEVs富集的RNAs顯示lncRNA編碼的新抗原被前列腺細(xì)胞系共享

原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35527349/

LncRNA-PACERR induces pro-tumour macrophages via interacting with miR-671-3p and m6A-reader IGF2BP2 in pancreatic ductal adenocarcinoma

LncRNA-PACERR通過與miR-671-3p和m6A-reader IGF2BP2相互作用誘導(dǎo)胰腺導(dǎo)管腺癌中的促腫瘤巨噬細(xì)胞

發(fā)表期刊：J Hematol Oncol

影響因子：17.388

發(fā)表時(shí)間：2022年5月7日

背景：LncRNA-PACERR在組織相關(guān)巨噬細(xì)胞（TAMs）的極化中起著關(guān)鍵作用。在本研究中，研究人員發(fā)現(xiàn)了PACERR在TAMs中調(diào)節(jié)胰腺導(dǎo)管腺癌（PDAC）進(jìn)展的功能和分子機(jī)制。

結(jié)果：LncRNA-PACERR在TAMs中高表達(dá)，與PDAC患者的不良預(yù)后相關(guān)。本研究發(fā)現(xiàn)驗(yàn)證了LncRNA-PACERR增加了M2極化細(xì)胞的數(shù)量，并在體外和體內(nèi)促進(jìn)了細(xì)胞的增殖、侵襲和遷移。機(jī)制上，LncRNA-PACERR通過與miR-671-3p結(jié)合激活KLF12/p-AKT/c-myc通路。而與IGF2BP2結(jié)合的LncRNA-PACERR以m6A依賴性方式增強(qiáng)了KLF12和c-myc在細(xì)胞質(zhì)中的穩(wěn)定性。此外，LncRNA-PACERR的啟動(dòng)子是KLF12的靶標(biāo)，LncRNA-PACERR通過在細(xì)胞核中與KLF12相互作用，募集EP300以增加組蛋白的乙酰化。

結(jié)論：本研究發(fā)現(xiàn)LncRNA-PACERR作為PDAC微環(huán)境中TAMs的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子，揭示了細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中的新機(jī)制。

Fig3. 模型圖展示了TAMs中LncRNA-PACERR和KLF12之間的正反饋回路，以促進(jìn)PDAC中的增殖和遷移

原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35526050/

Enhancer RNAs stimulate Pol II pause release by harnessing multivalent interactions to NELF

增強(qiáng)子RNAs通過利用與NELF的多價(jià)相互作用來刺激Pol II暫停釋放

發(fā)表期刊：Nat Commun

影響因子：14.919

發(fā)表時(shí)間：2022年5月4日

增強(qiáng)子RNAs（eRNAs）是源自增強(qiáng)子的長鏈非編碼RNAs。盡管eRNA轉(zhuǎn)錄是激活增強(qiáng)子的典型特征，但eRNA功能所需的分子特征以及eRNAs如何影響靶基因轉(zhuǎn)錄的機(jī)制尚未確定。因此，本研究使用eRNA依賴性RNA聚合酶II（Pol II）暫停釋放作為模型，研究了eRNAs的序列、結(jié)構(gòu)和長度對(duì)它們通過從暫停的Pol II中分離NELF來刺激Pol II暫停釋放能力的要求。研究發(fā)現(xiàn)eRNA并非通過常見的結(jié)構(gòu)或序列基序發(fā)揮其功能。相反，長度大于200個(gè)核苷酸且包含未配對(duì)鳥苷的eRNAs與NELF亞基-A和-E進(jìn)行多次變構(gòu)接觸，以觸發(fā)有效的NELF釋放。通過揭示eRNA功能的分子決定因素，本研究證實(shí)了eRNAs在Pol II暫停釋放中發(fā)揮了重要作用，并為研究后生動(dòng)物轉(zhuǎn)錄的調(diào)控提供了新的見解。

Fig4. eRNA和暫停延伸復(fù)合物（PEC）之間的多價(jià)變構(gòu)相互作用刺激Pol II暫停釋放模型示意圖

原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35508485/

Copy number amplification and SP1-activated lncRNA MELTF-AS1 regulates tumorigenesis by driving phase separation of YBX1 to activate ANXA8 in non-small cell lung cancer

拷貝數(shù)擴(kuò)增和SP1激活的lncRNA MELTF-AS1通過驅(qū)動(dòng)YBX1的相分離激活非小細(xì)胞肺癌中的ANXA8來調(diào)節(jié)腫瘤發(fā)生

發(fā)表期刊：Oncogene

影響因子：9.867

發(fā)表時(shí)間：2022年5月4日

據(jù)報(bào)道，長鏈非編碼RNAs（lncRNAs）在腫瘤發(fā)生中起著關(guān)鍵作用。然而，lncRNA介導(dǎo)的RNA結(jié)合蛋白相分離在腫瘤發(fā)生中的調(diào)控機(jī)制尚未完全闡明。本研究通過系統(tǒng)的數(shù)據(jù)分析、篩選和驗(yàn)證，鑒定出一個(gè)致癌lncRNA MELTF-AS1。MELTF-AS1在非小細(xì)胞肺癌（NSCLC）中顯著上調(diào)。高M(jìn)ELTF-AS1水平與晚期腫瘤-淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移期（TNM）、高腫瘤大小和生存時(shí)間縮短相關(guān)。功能上，MELTF-AS1在體外和體內(nèi)調(diào)節(jié)細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移。RNA測序分析顯示，MELTF-AS1敲低特異性調(diào)節(jié)了與細(xì)胞增殖、凋亡和遷移相關(guān)的基因。機(jī)制研究發(fā)現(xiàn)，在基因組水平上，拷貝數(shù)擴(kuò)增促進(jìn)了MELTF-AS1的表達(dá)。在轉(zhuǎn)錄水平上，轉(zhuǎn)錄因子SP1通過與其啟動(dòng)子結(jié)合直接激活MELTF-AS1的轉(zhuǎn)錄。此外，MELTF-AS1可以直接結(jié)合并驅(qū)動(dòng)YBX1（YBX1是一種RNA結(jié)合蛋白，參與腫瘤發(fā)生）的相分離，從而激活A(yù)NXA8轉(zhuǎn)錄，促進(jìn)NSCLC的腫瘤發(fā)生。已在多種腫瘤中發(fā)現(xiàn)了ANXA8的異常激活和促進(jìn)腫瘤發(fā)生。這些新發(fā)現(xiàn)證明了MELTF-AS1驅(qū)動(dòng)的相分離介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控的關(guān)鍵作用，并為NSCLC提供了一個(gè)潛在的新型診斷和治療靶點(diǎn)。

Fig5. MELTF-AS1介導(dǎo)的NSCLC增殖和轉(zhuǎn)移模型

原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35508543/