lncRNA新研究進(jìn)展盤點(diǎn)（20210520）

Nat Cell Biol丨LIMIT是一種癌癥免疫和免疫療法中具有免疫原性的lncRNA

IF：20.040? 2021年5月6日

MHC-1（主要組織相容性復(fù)合物-I）將腫瘤抗原呈遞給CD8+ T細(xì)胞，并觸發(fā)抗腫瘤免疫。人類可能擁有30,000-60,000個(gè)長(zhǎng)鏈非編碼RNAs（lncRNAs）。然而，對(duì)于lncRNAs是否影響腫瘤免疫仍然知之甚少。本研究在人類和小鼠中鑒定了一個(gè)lncRNA LIMIT（lncRNA誘導(dǎo)MHC-I和腫瘤的免疫原性）。研究發(fā)現(xiàn)IFNγ刺激LIMIT，LIMIT順式激活GBP（鳥苷酸結(jié)合蛋白）基因簇，而GBPs破壞了HSP90與HSF1（熱休克因子1）之間的相互作用，從而導(dǎo)致HSF1的激活和MHC-I機(jī)制的轉(zhuǎn)錄，而不是PD-L1。LIMIT的CRISPR激活增強(qiáng)了GBPs和MHC-1，并增強(qiáng)了腫瘤的免疫原性和檢查點(diǎn)療法。沉默LIMIT、GBP和/或HSF1會(huì)降低MHC-1的水平，削弱抗腫瘤免疫并削弱免疫療法的功效。臨床上，癌癥患者的LIMIT、GBP和HSF1信號(hào)轉(zhuǎn)錄和蛋白與MHC-1、腫瘤浸潤(rùn)性T細(xì)胞和檢查點(diǎn)封鎖反應(yīng)相關(guān)。總之，本研究證明了LIMIT是一種具有癌癥免疫原性的lncRNA，并且LIMIT-GBP-HSF1軸可能是針對(duì)癌癥免疫療法的靶標(biāo)。

Fig1. 示意圖顯示LIMIT-GBP-HSF1軸如何影響MHC-I和腫瘤免疫

原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33958760/

Blood丨髓樣lncRNA LOUP在t(8;21) AML中介導(dǎo)RUNX1和RUNX1-ETO的相反調(diào)控作用

IF：17.544? 2021年5月10日

在白血病中，普遍存在的轉(zhuǎn)錄因子以及由它們的嵌合衍生物引起的破壞所介導(dǎo)的細(xì)胞類型特異性基因誘導(dǎo)的潛在機(jī)制尚不清楚。本研究調(diào)查了RNAs是否與轉(zhuǎn)錄因子協(xié)調(diào)以驅(qū)動(dòng)髓樣基因轉(zhuǎn)錄。通過(guò)對(duì)與廣泛表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子RUNX1同時(shí)發(fā)生RNA和DNA相互作用的基因位點(diǎn)進(jìn)行整合全基因組分析，研究人員鑒定了長(zhǎng)鏈非編碼RNA LOUP。這種髓樣特異性和聚腺苷酸化的lncRNA誘導(dǎo)髓樣分化并抑制細(xì)胞生長(zhǎng)，充當(dāng)髓樣主調(diào)節(jié)因子PU.1的轉(zhuǎn)錄誘導(dǎo)物。機(jī)制上，LOUP將RUNX1募集到PU.1增強(qiáng)子和啟動(dòng)子上，從而導(dǎo)致活性染色質(zhì)環(huán)的形成。在t(8;21)急性髓系白血病中，RUNX1與ETO融合，產(chǎn)生的致癌融合蛋白R(shí)UNX1-ETO限制了LOUP位點(diǎn)的染色質(zhì)可及性，從而抑制了LOUP和PU.1的表達(dá)。這些發(fā)現(xiàn)突顯了細(xì)胞類型特異性RNA與轉(zhuǎn)錄因子及其致癌衍生物之間的相互作用在調(diào)節(jié)譜系基因激活方面的重要作用，并提出了這樣一種可能，即轉(zhuǎn)錄因子的RNA調(diào)控因子代表了治療發(fā)展的替代靶標(biāo)。

Fig2. LOUP與RUNX1協(xié)調(diào)以調(diào)節(jié)染色質(zhì)環(huán)化導(dǎo)致PU.1誘導(dǎo)、髓樣分化和細(xì)胞生長(zhǎng)，以及RUNX1-ETO干擾LOUP介導(dǎo)的分子功能的模型示意圖

原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33971010/

J Hematol Oncol丨腦腫瘤中的lncRNAs：作為治療靶標(biāo)的作用和潛力

IF：11.506? 2021年5月12日

盡管放射療法、化學(xué)療法和光動(dòng)力療法有所改善，但腦腫瘤仍與不良預(yù)后相關(guān)。然而，治療方法在不斷發(fā)展，新的生物學(xué)現(xiàn)象正在被探索，以鑒定出合適的腦腫瘤治療方法。長(zhǎng)鏈非編碼RNAs（lncRNAs）是一種長(zhǎng)度超過(guò)200個(gè)核苷酸的非編碼RNA，可在轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后和表觀遺傳水平上調(diào)節(jié)基因表達(dá)，并參與多種生物學(xué)功能。最近對(duì)lncRNAs的研究表明，它們?cè)诟鞣N癌癥中異常表達(dá)，并具有與它們?cè)诎┌Y中的重要作用相關(guān)的獨(dú)特表達(dá)模式。腦腫瘤中也鑒定出lncRNA的異常表達(dá)。本文綜述了lncRNAs在腦腫瘤中的潛在作用及其生物學(xué)功能。總結(jié)了目前對(duì)lncRNAs相關(guān)分子機(jī)制和信號(hào)通路的理解，這些可能指導(dǎo)腦腫瘤治療的臨床試驗(yàn)。

Fig3. 基于lncRNAs功能機(jī)制分類

原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33980320/

Cell Death Differ丨lncRNA PFI通過(guò)與剪接調(diào)節(jié)因子SRSF1相互作用來(lái)預(yù)防肺纖維化

IF：10.715? 2021年5月12日

肺纖維化（PF）是一種病因復(fù)雜、死亡率高的間質(zhì)性肺炎，以肺泡間質(zhì)進(jìn)行性瘢痕化和肌纖維母細(xì)胞病變?yōu)樘卣鳌＝陙?lái)，長(zhǎng)鏈非編碼RNAs（lncRNAs）在器官纖維化中的重要性越來(lái)越受到重視。本研究的目的是調(diào)查lncRNAs在肺纖維化中的作用。通過(guò)使用qRT-PCR以鑒定博萊霉素（BLM）誘導(dǎo)的實(shí)驗(yàn)性肺纖維化小鼠肺中異常調(diào)節(jié)的lncRNAs，并進(jìn)行了一系列分子分析，以評(píng)估新型lncRNA NONMMUT060091（稱為肺纖維化抑制劑，PFI）的作用，其在肺纖維化中顯著下調(diào)。功能上，通過(guò)smart silencer敲低內(nèi)源性PFI可促進(jìn)原代小鼠肺成纖維細(xì)胞（MLF）的增殖、分化和細(xì)胞外基質(zhì)（ECM）沉積。相反，PFI的過(guò)度表達(dá)在MLFs和人胎兒肺成纖維細(xì)胞MRC-5細(xì)胞中均部分消除了TGF-β1誘導(dǎo)的纖維發(fā)生。同樣，與野生型（WT）小鼠相比，PFI過(guò)表達(dá)減輕了BLM誘導(dǎo)的肺纖維化。機(jī)制上，PFI直接結(jié)合SRSF1（絲氨酸和富含精氨酸剪接因子1），并抑制其表達(dá)和促纖維化活性。此外，SRSF1的沉默通過(guò)限制EDA + Fn1剪接異構(gòu)體的形成可抑制TRC-β1誘導(dǎo)的MRC-5細(xì)胞的增殖、分化和ECM沉積。而強(qiáng)制表達(dá)SRSF1可消除PFI在BLM治療小鼠中的抗纖維化作用。總體而言，這些數(shù)據(jù)表明PFI通過(guò)負(fù)調(diào)節(jié)SRSF1的表達(dá)和活性以減少EDA + Fn1剪接異構(gòu)體的形成，從而減輕肺纖維化，提示PFI和SRSF1可能是治療肺纖維化的潛在靶標(biāo)。

Fig4. lncRNA PFI與SRSF1結(jié)合以抑制其在選擇性剪接中的功能機(jī)制模型

原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33981019/

Cell Death Differ丨lncRNA AVAN通過(guò)與TRIM25相互作用并增強(qiáng)FOXO3a的轉(zhuǎn)錄來(lái)促進(jìn)抗病毒先天免疫

IF：10.715? 2021年5月14日

越來(lái)越多的證據(jù)表明，長(zhǎng)鏈非編碼RNAs（lncRNAs）參與了多個(gè)生物學(xué)過(guò)程，包括免疫反應(yīng)。然而，lncRNAs在抗病毒先天免疫應(yīng)答中的作用在很大程度上仍然未知。本研究從甲型流感病毒（IAV）感染的患者中鑒定出一個(gè)未表征的人源lncRNA AVAN，其在RNA病毒感染后顯著上調(diào)。在IAV感染期間，AVAN在抗病毒免疫反應(yīng)中起著不可或缺的作用。在體內(nèi)，強(qiáng)制表達(dá)AVAN顯著減輕了IAV毒力和病毒復(fù)制。機(jī)制上，核AVAN通過(guò)與FOXO3a（叉頭框蛋白O3a）啟動(dòng)子結(jié)合，并誘導(dǎo)染色質(zhì)重塑，以促進(jìn)嗜中性粒細(xì)胞趨化性，從而正向調(diào)控FOXO3a的轉(zhuǎn)錄。同時(shí)，細(xì)胞質(zhì)AVAN直接與E3連接酶TRIM25結(jié)合并增強(qiáng)TRIM25介導(dǎo)的k63連接的RIG-I泛素化，從而促進(jìn)TRIM25和RIG-I介導(dǎo)的抗病毒先天免疫應(yīng)答，包括I型干擾素和ISGs的誘導(dǎo)。此外，AVAN與TRIM25的B Box/CCD結(jié)構(gòu)域結(jié)合，并且AVAN的1-200nt是功能性基團(tuán)。總之，本研究結(jié)果突顯了人類lncRNA AVAN作為抗病毒先天免疫應(yīng)答的關(guān)鍵正調(diào)節(jié)因子的潛在臨床意義，以及開(kāi)發(fā)廣泛抗病毒治療的一個(gè)有希望的靶標(biāo)。

Fig5. AVAN調(diào)節(jié)抗病毒先天免疫反應(yīng)的機(jī)制示意圖

原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33990776/

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