Gene ID或轉(zhuǎn)錄本快速查找方法
如何查找Gene ID？
1、點擊訪問NCBI網(wǎng)站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
2、在首頁中下圖的選擇框處選擇“Gene”
3、選取“Gene”后在空白框中輸入基因名稱，或轉(zhuǎn)錄本號，點擊“Search”，此處以基因GAPDH為例。
4、在搜索結(jié)果中找到所需基因ID。注意圖中紅框處的物種信息，依據(jù)自己所需要的物種選擇基因。以人源GAPDH基因為例，其基因ID即在箭頭所指處。如果點擊基因名稱，則可看到該基因的位置、轉(zhuǎn)錄本、參考文獻等眾多其它信息。
如何查找轉(zhuǎn)錄本號（Transcript ID）？
1.找到你感興趣的Gene ID和物種所對應的一個基因名，點擊這個基因名，打開一個新的頁面；
2.下翻網(wǎng)頁找到NCBI Reference Sequences (RefSeq)區(qū)域，mRNA and Protein(s)，即可找到該Gene ID下面的一個或多個轉(zhuǎn)錄本號（Transcript ID），選擇您最終要研究的轉(zhuǎn)錄本號。
如何查找miRNA Accession？
登錄miBase網(wǎng)站，輸入miRNA名稱，提交即可查找到Accession No.以及是否為成熟體（Mature）.
如何查找其他相關基因或RNA的數(shù)據(jù)庫信息？
更多基因或轉(zhuǎn)錄本信息，請查詢?nèi)缦戮W(wǎng)站。
NCBI數(shù)據(jù)庫：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
miRBase（miRNA研究常用數(shù)據(jù)庫）：http://www.mirbase.org/search.shtml
circBase（circRNA研究常用數(shù)據(jù)庫）：http://www.circbase.org/
piRNABank（piRNA研究常用數(shù)據(jù)庫）：http://pirnabank.ibab.ac.in/
NONCODE（lncRNA研究）：http://www.microvesicles.org/
lncRNAdb（lncRNA研究數(shù)據(jù)庫）：http://student4.postech.ac.kr/evpedia2_xe/xe/
lncRNA Database（lncRNA研究數(shù)據(jù)庫）：http://www.valadkhanlab.org/database
以上數(shù)據(jù)庫信息最終解釋權(quán)歸該數(shù)據(jù)庫所有者。
