下面為大家解讀一下該新策略吧！

1）?如何快速進(jìn)行RBP功能篩選？

常見的RBP功能篩選研究方法是先通過高通量測序、進(jìn)行多次基于數(shù)據(jù)庫生物信息學(xué)分析逐步篩選目的基因，或基因文獻(xiàn)挖掘來尋找已知的RBP編碼基因，然后再借助各種繁瑣的細(xì)胞學(xué)實(shí)驗(yàn)來研究RBP的功能。這看起來沒啥毛病，但過程卻是極其煎熬的，有木有？如果有一種更高效快捷且精準(zhǔn)的方法，您想不想知道呢~~~

RBP siRNA文庫+高內(nèi)涵分析與篩選一步輕松搞定RBP功能篩選

近年來，基因文庫越來越多地應(yīng)用于高通量篩選目的基因功能或?qū)ふ胰碌淖饔冒悬c(diǎn)，因?yàn)檫@種方法極其快速高效，可以一網(wǎng)打盡所有感興趣的靶標(biāo)或序列，不僅數(shù)倍縮短實(shí)驗(yàn)周期，單位篩選成本比合成單個或幾個基因更低，還可以讓科學(xué)家騰出大把時間進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)，比如RBP與RNA相互作用調(diào)控機(jī)制研究，或者其作用域/結(jié)合位點(diǎn)的研究等。

銳博生物憑借多年RNAi文庫經(jīng)驗(yàn)，自主研發(fā)了人類RBP siRNA文庫，結(jié)合亞洲領(lǐng)先的IN Cell激光共聚焦高內(nèi)涵分析與篩選平臺，只需簡單地將RBP siRNA文庫序列轉(zhuǎn)染進(jìn)細(xì)胞，隨后通過高內(nèi)涵平臺進(jìn)行高通量RBP功能篩選，從而全面鑒定出與某個生物學(xué)過程或通路有關(guān)的候選RBP，從而指導(dǎo)下游RBP與RNA相互作用的研究，由于高內(nèi)涵文庫篩選出的基因功能都更為確定，大大減輕了后續(xù)的功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)，讓科學(xué)家對蛋白質(zhì)與lncRNA及其他相關(guān)RNA分子的研究進(jìn)程大大加快。

銳博生物高內(nèi)涵成像與分析篩選實(shí)驗(yàn)一般流程

對于還不熟悉基因文庫的您，我們再進(jìn)一步介紹一下RBP文庫。

genOFF??RBP siRNA Premix Library

1、RBP文庫涵蓋1199個重要RBP基因，靶向不同轉(zhuǎn)錄本，覆蓋面更廣
2、采用優(yōu)化的siCatch?siRNA設(shè)計(jì)方法，沉默效率更高，脫靶更低
3、采用96孔板封裝，每孔對應(yīng)一個基因，可做50次篩選（工作濃度50nM）
4、一次實(shí)驗(yàn)即可分析大批量基因，實(shí)現(xiàn)大規(guī)模高通量的功能篩選

激光共聚焦高內(nèi)涵分析與篩選

銳博生物重磅推出的激光共聚焦高內(nèi)涵分析與篩選服務(wù)(HCA&HCS)，利用優(yōu)秀的成像技術(shù)及強(qiáng)大的圖像處理技術(shù)，從細(xì)胞或細(xì)胞群體中提取信號數(shù)據(jù)，進(jìn)行包含細(xì)胞及亞細(xì)胞形態(tài)結(jié)構(gòu)信息等的多參數(shù)量化分析，結(jié)合高速成像甚至自動化的成像檢測，建立標(biāo)準(zhǔn)化的分析流程分析參數(shù)，可實(shí)現(xiàn)快速高通量篩選的工作。基于高內(nèi)涵篩選本身的特性，幾乎所有基于熒光成像檢測和分析的技術(shù)都可直接在高內(nèi)涵平臺上獲得更有價值的發(fā)現(xiàn)，IN Cell激光共聚焦高內(nèi)涵平臺可提供完美細(xì)胞影像與精準(zhǔn)定量信息，誕生更高價值的數(shù)據(jù)影像結(jié)果。

相比傳統(tǒng)的生物學(xué)功能與機(jī)制研究手段，HCA&HCS在發(fā)現(xiàn)新的靶點(diǎn)、功能及機(jī)制方面能夠：

1、更深入理解復(fù)雜的細(xì)胞學(xué)機(jī)理和相互作用
2、非破壞性活細(xì)胞功能的多標(biāo)記/多靶點(diǎn)/多參數(shù)分析與篩選
3、高通量快速大規(guī)模細(xì)胞學(xué)分析，從單個細(xì)胞至細(xì)胞群組
4、實(shí)驗(yàn)時間從幾天縮短至幾個小時或幾分鐘
5、提出更多細(xì)胞學(xué)問題，產(chǎn)生更多原創(chuàng)新研究成果

當(dāng)然，如果您的樣本量比較大或不考慮細(xì)胞成像的質(zhì)量，還可以選擇銳博生物的Acumen eX3平臺進(jìn)行基因功能篩選。如果您第一步就采用高內(nèi)涵文庫篩選策略，文章的檔次水平相比傳統(tǒng)研究策略已是大幅度提高了！因?yàn)榛诩?xì)胞表型的功能篩選大數(shù)據(jù)結(jié)果往往更佳的可靠性和說服力！

通過RBP siRNA文庫+高內(nèi)涵分析與篩選方法確定目標(biāo)RBP的細(xì)胞表型及基因功能后，RBP是如何發(fā)揮作用的呢？與其直接結(jié)合的關(guān)鍵RNA靶標(biāo)有哪些？為了解決上述問題，銳博生物還可提供RIP-Seq/CLIP-Seq 測序服務(wù)用于識別RBP靶標(biāo)及RBP與RNA相互作用機(jī)制的研究。

2）??RBP結(jié)合RNA靶標(biāo)的鑒定

RNA免疫共沉淀測序（RIP-Seq）

1、全轉(zhuǎn)錄組覆蓋：可在全轉(zhuǎn)錄組范圍對蛋白結(jié)合位點(diǎn)進(jìn)行篩選與鑒定
2、高靈敏度：每個樣本可獲得數(shù)百萬條的序列標(biāo)簽，檢測轉(zhuǎn)錄組上稀有的蛋白結(jié)合位點(diǎn)
3、高精確率：可獲得高水平的信噪比數(shù)據(jù)，準(zhǔn)確區(qū)分真實(shí)事件與噪音
4、紫外交聯(lián)免疫沉淀結(jié)合測序（CLIP-Seq）
5、準(zhǔn)確性高：從活細(xì)胞交聯(lián)開始，真實(shí)反映體內(nèi)環(huán)境下的分子間相互作用
6、特異性強(qiáng)：紫外輻射不會造成蛋白和蛋白之間的交聯(lián)，特異性鑒定蛋白和RNA之間的相互作用
7、應(yīng)用廣泛：特別適用于剪接因子RNA結(jié)合圖譜、miRNA作用靶點(diǎn)等研究

3）??RNA分子功能研究

通過RIP-Seq/CLIP-Seq和生物信息分析確定RBP結(jié)合的RNA靶標(biāo)后，RNA分子功能研究也是需要進(jìn)一步解決的科學(xué)問題，從而進(jìn)一步提高文章的檔次水平。銳博生物提供各類RNA分子體外/體內(nèi)的功能研究解決方案，從細(xì)胞實(shí)驗(yàn)到動物實(shí)驗(yàn)，涵蓋領(lǐng)先的miRNA、lncRNA和circRNA的設(shè)計(jì)合成產(chǎn)品，受到廣大研究人員的高度認(rèn)可。

所以，RBP研究不用那么復(fù)雜，只需一步，就能輕松搞定RBP功能篩選；只需三步，就能完成一篇RBP研究高質(zhì)量文章啦！