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Nat Cell Biol丨LIMIT是一種癌癥免疫和免疫療法中具有免疫原性的lncRNA

IF:20.040? 2021年5月6日

 

MHC-1(主要組織相容性復(fù)合物-I)將腫瘤抗原呈遞給CD8+ T細胞,并觸發(fā)抗腫瘤免疫。人類可能擁有30,000-60,000個長鏈非編碼RNAs(lncRNAs)。然而,對于lncRNAs是否影響腫瘤免疫仍然知之甚少。本研究在人類和小鼠中鑒定了一個lncRNA LIMIT(lncRNA誘導(dǎo)MHC-I和腫瘤的免疫原性)。研究發(fā)現(xiàn)IFNγ刺激LIMIT,LIMIT順式激活GBP(鳥苷酸結(jié)合蛋白)基因簇,而GBPs破壞了HSP90與HSF1(熱休克因子1)之間的相互作用,從而導(dǎo)致HSF1的激活和MHC-I機制的轉(zhuǎn)錄,而不是PD-L1。LIMIT的CRISPR激活增強了GBPs和MHC-1,并增強了腫瘤的免疫原性和檢查點療法。沉默LIMIT、GBP和/或HSF1會降低MHC-1的水平,削弱抗腫瘤免疫并削弱免疫療法的功效。臨床上,癌癥患者的LIMIT、GBP和HSF1信號轉(zhuǎn)錄和蛋白與MHC-1、腫瘤浸潤性T細胞和檢查點封鎖反應(yīng)相關(guān)。總之,本研究證明了LIMIT是一種具有癌癥免疫原性的lncRNA,并且LIMIT-GBP-HSF1軸可能是針對癌癥免疫療法的靶標。

 

Fig1. 示意圖顯示LIMIT-GBP-HSF1軸如何影響MHC-I和腫瘤免疫

 

原文鏈接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33958760/

 

 

 

Blood丨髓樣lncRNA LOUP在t(8;21) AML中介導(dǎo)RUNX1和RUNX1-ETO的相反調(diào)控作用

IF:17.544? 2021年5月10日

 

在白血病中,普遍存在的轉(zhuǎn)錄因子以及由它們的嵌合衍生物引起的破壞所介導(dǎo)的細胞類型特異性基因誘導(dǎo)的潛在機制尚不清楚。本研究調(diào)查了RNAs是否與轉(zhuǎn)錄因子協(xié)調(diào)以驅(qū)動髓樣基因轉(zhuǎn)錄。通過對與廣泛表達的轉(zhuǎn)錄因子RUNX1同時發(fā)生RNA和DNA相互作用的基因位點進行整合全基因組分析,研究人員鑒定了長鏈非編碼RNA LOUP。這種髓樣特異性和聚腺苷酸化的lncRNA誘導(dǎo)髓樣分化并抑制細胞生長,充當(dāng)髓樣主調(diào)節(jié)因子PU.1的轉(zhuǎn)錄誘導(dǎo)物。機制上,LOUP將RUNX1募集到PU.1增強子和啟動子上,從而導(dǎo)致活性染色質(zhì)環(huán)的形成。在t(8;21)急性髓系白血病中,RUNX1與ETO融合,產(chǎn)生的致癌融合蛋白RUNX1-ETO限制了LOUP位點的染色質(zhì)可及性,從而抑制了LOUP和PU.1的表達。這些發(fā)現(xiàn)突顯了細胞類型特異性RNA與轉(zhuǎn)錄因子及其致癌衍生物之間的相互作用在調(diào)節(jié)譜系基因激活方面的重要作用,并提出了這樣一種可能,即轉(zhuǎn)錄因子的RNA調(diào)控因子代表了治療發(fā)展的替代靶標。

 

 

Fig2. LOUP與RUNX1協(xié)調(diào)以調(diào)節(jié)染色質(zhì)環(huán)化導(dǎo)致PU.1誘導(dǎo)、髓樣分化和細胞生長,以及RUNX1-ETO干擾LOUP介導(dǎo)的分子功能的模型示意圖

 

原文鏈接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33971010/

 

 

 

J Hematol Oncol丨腦腫瘤中的lncRNAs:作為治療靶標的作用和潛力

IF:11.506? 2021年5月12日

 

盡管放射療法、化學(xué)療法和光動力療法有所改善,但腦腫瘤仍與不良預(yù)后相關(guān)。然而,治療方法在不斷發(fā)展,新的生物學(xué)現(xiàn)象正在被探索,以鑒定出合適的腦腫瘤治療方法。長鏈非編碼RNAs(lncRNAs)是一種長度超過200個核苷酸的非編碼RNA,可在轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后和表觀遺傳水平上調(diào)節(jié)基因表達,并參與多種生物學(xué)功能。最近對lncRNAs的研究表明,它們在各種癌癥中異常表達,并具有與它們在癌癥中的重要作用相關(guān)的獨特表達模式。腦腫瘤中也鑒定出lncRNA的異常表達。本文綜述了lncRNAs在腦腫瘤中的潛在作用及其生物學(xué)功能。總結(jié)了目前對lncRNAs相關(guān)分子機制和信號通路的理解,這些可能指導(dǎo)腦腫瘤治療的臨床試驗。

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Fig3. 基于lncRNAs功能機制分類

 

原文鏈接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33980320/

 

 

 

Cell Death Differ丨lncRNA PFI通過與剪接調(diào)節(jié)因子SRSF1相互作用來預(yù)防肺纖維化

IF:10.715? 2021年5月12日

 

肺纖維化(PF)是一種病因復(fù)雜、死亡率高的間質(zhì)性肺炎,以肺泡間質(zhì)進行性瘢痕化和肌纖維母細胞病變?yōu)樘卣鳌=陙恚L鏈非編碼RNAs(lncRNAs)在器官纖維化中的重要性越來越受到重視。本研究的目的是調(diào)查lncRNAs在肺纖維化中的作用。通過使用qRT-PCR以鑒定博萊霉素(BLM)誘導(dǎo)的實驗性肺纖維化小鼠肺中異常調(diào)節(jié)的lncRNAs,并進行了一系列分子分析,以評估新型lncRNA NONMMUT060091(稱為肺纖維化抑制劑,PFI)的作用,其在肺纖維化中顯著下調(diào)。功能上,通過smart silencer敲低內(nèi)源性PFI可促進原代小鼠肺成纖維細胞(MLF)的增殖、分化和細胞外基質(zhì)(ECM)沉積。相反,PFI的過度表達在MLFs和人胎兒肺成纖維細胞MRC-5細胞中均部分消除了TGF-β1誘導(dǎo)的纖維發(fā)生。同樣,與野生型(WT)小鼠相比,PFI過表達減輕了BLM誘導(dǎo)的肺纖維化。機制上,PFI直接結(jié)合SRSF1(絲氨酸和富含精氨酸剪接因子1),并抑制其表達和促纖維化活性。此外,SRSF1的沉默通過限制EDA + Fn1剪接異構(gòu)體的形成可抑制TRC-β1誘導(dǎo)的MRC-5細胞的增殖、分化和ECM沉積。而強制表達SRSF1可消除PFI在BLM治療小鼠中的抗纖維化作用。總體而言,這些數(shù)據(jù)表明PFI通過負調(diào)節(jié)SRSF1的表達和活性以減少EDA + Fn1剪接異構(gòu)體的形成,從而減輕肺纖維化,提示PFI和SRSF1可能是治療肺纖維化的潛在靶標。

 

 

Fig4. lncRNA PFI與SRSF1結(jié)合以抑制其在選擇性剪接中的功能機制模型

 

原文鏈接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33981019/

 

 

 

Cell Death Differ丨lncRNA AVAN通過與TRIM25相互作用并增強FOXO3a的轉(zhuǎn)錄來促進抗病毒先天免疫

IF:10.715? 2021年5月14日

 

越來越多的證據(jù)表明,長鏈非編碼RNAs(lncRNAs)參與了多個生物學(xué)過程,包括免疫反應(yīng)。然而,lncRNAs在抗病毒先天免疫應(yīng)答中的作用在很大程度上仍然未知。本研究從甲型流感病毒(IAV)感染的患者中鑒定出一個未表征的人源lncRNA AVAN,其在RNA病毒感染后顯著上調(diào)。在IAV感染期間,AVAN在抗病毒免疫反應(yīng)中起著不可或缺的作用。在體內(nèi),強制表達AVAN顯著減輕了IAV毒力和病毒復(fù)制。機制上,核AVAN通過與FOXO3a(叉頭框蛋白O3a)啟動子結(jié)合,并誘導(dǎo)染色質(zhì)重塑,以促進嗜中性粒細胞趨化性,從而正向調(diào)控FOXO3a的轉(zhuǎn)錄。同時,細胞質(zhì)AVAN直接與E3連接酶TRIM25結(jié)合并增強TRIM25介導(dǎo)的k63連接的RIG-I泛素化,從而促進TRIM25和RIG-I介導(dǎo)的抗病毒先天免疫應(yīng)答,包括I型干擾素和ISGs的誘導(dǎo)。此外,AVAN與TRIM25的B Box/CCD結(jié)構(gòu)域結(jié)合,并且AVAN的1-200nt是功能性基團。總之,本研究結(jié)果突顯了人類lncRNA AVAN作為抗病毒先天免疫應(yīng)答的關(guān)鍵正調(diào)節(jié)因子的潛在臨床意義,以及開發(fā)廣泛抗病毒治療的一個有希望的靶標。

 

 

Fig5. AVAN調(diào)節(jié)抗病毒先天免疫反應(yīng)的機制示意圖

 

原文鏈接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33990776/

 

 

 

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