Transcriptome and chromatin alterations in social fear indicate association of MEG3 with successful extinction of fear
社交恐懼中的轉(zhuǎn)錄組和染色質(zhì)改變表明MEG3與成功消除恐懼有關(guān)
發(fā)表期刊：Mol Psychiatry
影響因子：15.992
發(fā)表時(shí)間：2022年3月25日
社交焦慮障礙的特征是對(duì)社交場(chǎng)合的持續(xù)恐懼和回避，但可用的治療方案相當(dāng)不明確。使用已建立的小鼠社交恐懼條件反射（SFC）范例，研究人員分析了社交恐懼獲得和消失后隔膜內(nèi)（隔膜是對(duì)社交恐懼和社交行為很重要的大腦區(qū)域）的基因表達(dá)和染色質(zhì)改變。本研究特別關(guān)注社交恐懼消除訓(xùn)練的成功與不成功結(jié)果，這對(duì)應(yīng)于臨床中對(duì)治療有反應(yīng)的患者與耐藥的患者。編碼和非編碼RNAs的驗(yàn)證揭示了長(zhǎng)鏈非編碼RNA (lncRNA) Meg3的特定亞型受到調(diào)節(jié)，這取決于社交恐懼的成功消除。此外，PI3K/AKT在SFC小鼠中被差異激活并成功消除。體內(nèi)敲低特定Meg3亞型增加了PI3K/AKT信號(hào)的基線活性，并輕微延遲了社交恐懼的消除。使用ATAC-Seq和CUT&RUN，研究人員發(fā)現(xiàn)特定基因的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)發(fā)生了改變，這可能是lncRNA Meg3的直接靶標(biāo)。
Fig1. Meg3-ex10功能缺失導(dǎo)致社交恐懼消除延遲
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35338311/
Long noncoding RNA NEAT1 promotes ferroptosis by modulating the miR-362-3p/MIOX axis as a ceRNA
長(zhǎng)鏈非編碼RNA NEAT1通過(guò)調(diào)節(jié)miR-362-3p/MIOX軸作為ceRNA促進(jìn)鐵死亡
發(fā)表期刊：Cell Death Differ
影響因子：15.828
發(fā)表時(shí)間：2022年3月25日
鐵死亡是一種由鐵依賴性脂質(zhì)過(guò)氧化誘導(dǎo)的新型調(diào)節(jié)性細(xì)胞死亡，在腫瘤的發(fā)展和耐藥性中起重要作用。據(jù)報(bào)道，lncRNA NEAT1參與調(diào)節(jié)腫瘤細(xì)胞周期、增殖、凋亡和遷移。然而，NEAT1在調(diào)節(jié)腫瘤鐵死亡中的功能和分子機(jī)制仍不清楚。本研究發(fā)現(xiàn)鐵死亡誘導(dǎo)劑erastin和RSL3通過(guò)促進(jìn)p53與NEAT1啟動(dòng)子的結(jié)合來(lái)增加NEAT1的表達(dá)。誘導(dǎo)NEAT1通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miR-362-3p促進(jìn)MIOX的表達(dá)。MIOX增加了ROS的產(chǎn)生并降低了細(xì)胞內(nèi)NADPH和GSH的水平，從而導(dǎo)致erastin和RSL3誘導(dǎo)的鐵死亡增強(qiáng)。重要的是，在體外和體內(nèi)，NEAT1的過(guò)表達(dá)通過(guò)增強(qiáng)鐵死亡增加了erastin和RSL3的抗腫瘤活性。總的來(lái)說(shuō)，這些數(shù)據(jù)表明NEAT1通過(guò)調(diào)節(jié)miR-362-3p和MIOX在鐵死亡中發(fā)揮著新的、不可或缺的作用。考慮到HCC患者對(duì)化療和免疫治療不敏感的臨床發(fā)現(xiàn)，對(duì)于NEAT1高表達(dá)的HCC患者，鐵死亡誘導(dǎo)可能是一種有前景的治療策略。
Fig2. NEAT1/miR-362-3p/MIOX軸調(diào)控HCC細(xì)胞鐵死亡示意圖
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35338333/
WTAP-mediated m6A modification of lncRNA NORAD promotes intervertebral disc degeneration
WTAP介導(dǎo)的lncRNA NORAD m6A修飾促進(jìn)椎間盤退行性變
發(fā)表期刊：Nat Commun
影響因子：14.913
發(fā)表時(shí)間：2022年3月18日
N6-甲基腺苷（m6A）是轉(zhuǎn)錄后水平上最普遍的RNA修飾，涉及各種疾病和細(xì)胞過(guò)程。然而，m6A調(diào)節(jié)椎間盤退行性變（IVDD）的潛在機(jī)制仍然不清楚。本研究通過(guò)m6A測(cè)序發(fā)現(xiàn)，lncRNA NORAD的甲基化在衰老的髓核細(xì)胞（NPCs）中顯著增加。隨后的功能缺失和獲得性實(shí)驗(yàn)表明，由于KDM5a介導(dǎo)的啟動(dòng)子H3K4me3的表觀遺傳增加，WTAP在衰老的NPCs中增加，并顯著促進(jìn)了NORAD m6A修飾。此外，YTHDF2介導(dǎo)的NORAD衰變?cè)谒ダ系腘PCs中增強(qiáng)，然后NORAD的缺失導(dǎo)致PUMILIO蛋白的螯合減少，這有助于增強(qiáng)PUM1/2的活性，從而抑制靶E2F3 mRNA的表達(dá)并促進(jìn)細(xì)胞衰老。本研究結(jié)果表明了中斷NORAD m6A修飾或NORAD/PUMILIO/E2F3軸可以作為抑制NPCs衰老和IVDD發(fā)展的潛在治療靶點(diǎn)。
Fig3. m6A修飾介導(dǎo)NPC衰老和IVDD進(jìn)展的機(jī)制示意圖
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35304463/
WDR82-binding long noncoding RNA lncEry controls mouse erythroid differentiation and maturation
WDR82結(jié)合的長(zhǎng)鏈非編碼RNA lncEry控制小鼠紅系分化和成熟
發(fā)表期刊：J Exp Med
影響因子：14.307
發(fā)表時(shí)間：2022年3月22日
造血分化受遺傳和表觀遺傳調(diào)節(jié)因子的控制。長(zhǎng)鏈非編碼RNAs（lncRNAs）已被證明在正常造血過(guò)程中發(fā)揮重要作用，但它們?cè)诩t細(xì)胞生成中的功能仍有待進(jìn)一步探索。本研究通過(guò)深度RNA測(cè)序分析了16個(gè)小鼠造血細(xì)胞群的轉(zhuǎn)錄組，并鑒定了一種新型lncRNA Gm15915，其在紅細(xì)胞相關(guān)的祖細(xì)胞和紅細(xì)胞中高度表達(dá)。因此，將其命名為lncEry。研究人員還鑒定了一種新的 lncEry亞型，這是以前沒有報(bào)道過(guò)的主要轉(zhuǎn)錄本。lncEry缺失導(dǎo)致紅細(xì)胞生成受損，表明lncRNA在調(diào)節(jié)紅細(xì)胞分化和成熟中發(fā)揮重要作用。機(jī)制上，lncEry與WDR82（WD重復(fù)蛋白82）相互作用以促進(jìn)Klf1和珠蛋白基因的轉(zhuǎn)錄，從而分別控制紅細(xì)胞生成的早期和晚期階段。這些發(fā)現(xiàn)將lncEry確定為紅細(xì)胞生成轉(zhuǎn)錄調(diào)控的重要參與者。
Fig4. lncEry與Wdr82結(jié)合參與紅細(xì)胞生成調(diào)控的機(jī)制模型
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35315911/
LncRNA GACAT2 binds with protein PKM1/2 to regulate cell mitochondrial function and cementogenesis in an inflammatory environment
LncRNA GACAT2與蛋白PKM1/2結(jié)合以調(diào)節(jié)炎癥環(huán)境中的細(xì)胞線粒體功能和牙骨質(zhì)發(fā)生
發(fā)表期刊：Bone Res
影響因子：13.567
發(fā)表時(shí)間：2022年3月16日
牙周膜干細(xì)胞（PDLSCs）是修復(fù)/再生丟失/受損牙周組織的關(guān)鍵細(xì)胞類型，包括牙槽骨、牙周膜和牙根牙骨質(zhì)，后者對(duì)于恢復(fù)牙齒功能至關(guān)重要。然而，存在于炎癥環(huán)境中的PDLSCs通常表現(xiàn)出受損的功能，正如其分化為負(fù)責(zé)牙骨質(zhì)再生的成牙骨質(zhì)細(xì)胞的能力受損所證明的那樣。本研究探討了線粒體功能和下游長(zhǎng)鏈非編碼RNAs（lncRNAs）在調(diào)節(jié)炎癥誘導(dǎo)的PDLSCs牙骨質(zhì)發(fā)生變化中的作用。研究發(fā)現(xiàn)炎癥細(xì)胞因子誘導(dǎo)的PDLSCs牙骨質(zhì)發(fā)生的損傷與其線粒體功能密切相關(guān)，lncRNA微陣列分析和功能獲得/缺失性研究確定GACAT2是作為參與炎癥介導(dǎo)的線粒體功能和牙骨質(zhì)發(fā)生的細(xì)胞事件的調(diào)節(jié)因子。隨后，通過(guò)質(zhì)譜（ChIRP-MS）和平行反應(yīng)監(jiān)測(cè)（PRM）分析對(duì)RNA結(jié)合蛋白進(jìn)行了全面鑒定，結(jié)果表明GACAT2可以直接結(jié)合與線粒體功能相關(guān)的蛋白質(zhì)PKM1/2（丙酮酸激酶M1/2）。進(jìn)一步的功能研究表明，GACAT2過(guò)表達(dá)增加了PKM1/2、PKM2四聚體和磷酸化PKM2的細(xì)胞蛋白表達(dá)，這導(dǎo)致丙酮酸激酶（PK）活性增強(qiáng)并增加了PKM2向線粒體的易位。然后研究人員發(fā)現(xiàn)GACAT2過(guò)表達(dá)可以逆轉(zhuǎn)炎癥誘導(dǎo)的PDLSCs對(duì)線粒體功能和成牙骨質(zhì)細(xì)胞分化的損害，并且這種效應(yīng)可以通過(guò)PKM1/2敲低來(lái)消除。本研究數(shù)據(jù)表明，lncRNA GACAT2通過(guò)與PKM1/2蛋白結(jié)合，在炎癥環(huán)境中調(diào)節(jié)線粒體功能和牙骨質(zhì)發(fā)生中發(fā)揮了關(guān)鍵作用。
Fig5. 炎癥環(huán)境下，lncRNA GACAT2在調(diào)節(jié)PDLSCs的線粒體功能和成牙骨質(zhì)細(xì)胞分化中起核心作用
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35296649/
