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環(huán)狀RNAs(circRNAs)屬于非編碼RNAs大家族。雖然其他所有的非編碼RNAs都是線性的,但circRNAs是共價(jià)閉合的單鏈RNAs,在不同組織中具有廣泛的表達(dá)模式。全基因組RNA測(cè)序分析顯示circRNAs具有很高的豐度和保守性。已有研究表明,circRNAs通常由外顯子2-5產(chǎn)生,其長度可能是一般外顯子的三倍。第二個(gè)外顯子通常充當(dāng)受體外顯子。大多數(shù)circRNAs的大小從幾百到幾千個(gè)核苷酸不等。CircRNAs的產(chǎn)生是因?yàn)榉聪蚣艚訉⒓艚庸w位點(diǎn)與序列上游的受體位點(diǎn)連接起來,形成一個(gè)共價(jià)閉合的環(huán)。最初,科學(xué)家發(fā)現(xiàn)一些circRNAs可以結(jié)合并吸附內(nèi)源性miRNA活性。由于circRNAs比線性轉(zhuǎn)錄本更穩(wěn)定,因此它們?cè)诔洚?dāng)miRNAs海綿方面可能更有效。許多circRNAs可能具有三維結(jié)構(gòu)并與蛋白質(zhì)結(jié)合形成RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物,從而調(diào)節(jié)結(jié)合蛋白的功能。circRNA測(cè)序數(shù)據(jù)顯示,許多直系同源circRNAs在進(jìn)化上是保守的,這表明這些circRNAs在調(diào)節(jié)細(xì)胞活動(dòng)中具有特定的生理作用。事實(shí)上,circRNAs已被證明在細(xì)胞增殖、自噬、凋亡、遷移、侵襲、蛋白質(zhì)合成以及組織纖維化和修復(fù)中發(fā)揮作用。因此,circRNAs與癌癥的發(fā)展有關(guān),包括乳腺癌、前列腺癌、結(jié)腸直腸癌、肝癌、肺癌等。

大多數(shù)文獻(xiàn)將circRNAs分為四類:外顯子circRNAs、內(nèi)含子circRNAs、外顯子-內(nèi)含子circRNAs和基因間circRNAs。超過90%的circRNAs由外顯子circRNAs組成。內(nèi)含子circRNAs是第二大circRNAs子集。接下來是內(nèi)含子保留的外顯子-內(nèi)含子circRNAs。一小部分被稱為基因間circRNAs的circRNAs位于已知基因位點(diǎn)之外。據(jù)報(bào)道,外顯子circRNAs主要在細(xì)胞質(zhì)中檢測(cè)到,而內(nèi)含子RNAs主要定位于細(xì)胞核。由于大多數(shù)circRNAs是由與有義鏈DNA相同方向產(chǎn)生的轉(zhuǎn)錄本反向剪接產(chǎn)生的,可以想象circRNAs的5’到3’方向也處于有義方向。然而,有數(shù)百個(gè)已知的circRNAs從相反方向轉(zhuǎn)錄,產(chǎn)生反義circRNAs。根據(jù)其有義對(duì)應(yīng)物的位置可將反義circRNAs分為三種類型:外顯子反義、內(nèi)含子反義和外顯子內(nèi)含子反義。研究人員在最近的circRNA高通量分析中檢測(cè)到超過1000個(gè)豐富的反義circRNAs。然而,反義circRNAs是一組迄今為止仍未被觸及的circRNAs,它們的生理功能尚不清楚。

為了探索反義circRNAs在乳腺癌發(fā)展中的作用。加拿大多倫多大學(xué)Burton B Yang研究組近日在Molecular Therapy期刊在線發(fā)表了題為An antisense circular RNA circSCRIB enhances cancer progression by suppressing parental gene splicing and translation的研究論文,報(bào)道了反義circSCRIB通過抑制親本基因剪接和翻譯來促進(jìn)癌癥進(jìn)展,表明通過增加針對(duì)癌基因的反義circRNAs和沉默針對(duì)腫瘤抑制基因的反義circRNAs,反義circRNAs可作為癌癥干預(yù)的靶點(diǎn)。

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研究人員通過對(duì)乳腺癌標(biāo)本進(jìn)行高通量分析發(fā)現(xiàn)了209個(gè)反義circRNAs顯著富集。腫瘤抑制因子SCRIB被證明可能產(chǎn)生13個(gè)circRNAs,其中3個(gè)呈反義方向。在這3個(gè)circRNAs中,circSCRIB(hsa_circ_0001831)在乳腺癌中最豐富。研究發(fā)現(xiàn)這種反義SCRIB circRNA跨越一個(gè)內(nèi)含子和兩個(gè)外顯子。

 

反義circRNAs的結(jié)構(gòu)及其工作假說模型

 

隨后,研究人員假設(shè)這種circRNA可以減少pre-mRNA剪接和mRNA翻譯。為了測(cè)試這一點(diǎn),研究人員生成了一個(gè)hsa_circ_0001831表達(dá)載體。結(jié)果發(fā)現(xiàn)SCRIB mRNA的產(chǎn)生減少,但癌細(xì)胞增殖、遷移和侵襲增加。相比之下,外顯子序列載體不影響mRNA剪接,但會(huì)降低蛋白質(zhì)翻譯,導(dǎo)致E-cadherin表達(dá)增加,N-cadherin和vimentin表達(dá)降低。因此,細(xì)胞遷移、侵襲、增殖、集落形成和腫瘤發(fā)生增加。

 

抗外顯子-內(nèi)含子circRNA的表達(dá)抑制了pre-mRNA剪接

 

總之,本研究結(jié)果表明了反義circRNAs對(duì)其親本轉(zhuǎn)錄本具有新的調(diào)節(jié)作用。這可能代表了開發(fā)circRNA定向治療的一種有前景的方法。

 

 

原文鏈接:https://www.cell.com/molecular-therapy-family/molecular-therapy/pdf/S1525-0016(21)00396-8.pdf?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS1525001621003968%3Fshowall%3Dtrue

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